MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Geobacter sulfurreducens PCA chromosome

Total Repeats: 83814

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002939	GAA	2	6	33	38	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	47525234
2	NC_002939	CAATC	2	10	54	63	40 %	20 %	0 %	40 %	47525234
3	NC_002939	CA	3	6	77	82	50 %	0 %	0 %	50 %	47525234
4	NC_002939	AAG	2	6	129	134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	47525234
5	NC_002939	TGC	3	9	139	147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	47525234
6	NC_002939	CCG	2	6	310	315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	47525234
7	NC_002939	CAAC	2	8	349	356	50 %	0 %	0 %	50 %	47525234
8	NC_002939	GCG	2	6	391	396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	47525234
9	NC_002939	GCA	2	6	397	402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	47525234
10	NC_002939	CGG	2	6	418	423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	47525234
11	NC_002939	CGGC	2	8	445	452	0 %	0 %	50 %	50 %	47525234
12	NC_002939	CCT	2	6	503	508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	47525234
13	NC_002939	GAAC	2	8	584	591	50 %	0 %	25 %	25 %	47525234
14	NC_002939	TCA	2	6	592	597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	47525234
15	NC_002939	CTGC	2	8	599	606	0 %	25 %	25 %	50 %	47525234
16	NC_002939	AGA	2	6	613	618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	47525234
17	NC_002939	TTC	2	6	655	660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	47525234
18	NC_002939	CGA	2	6	665	670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	47525234
19	NC_002939	AGG	2	6	703	708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	47525234
20	NC_002939	AAG	2	6	885	890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	47525234
21	NC_002939	CGA	2	6	917	922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	47525234
22	NC_002939	CAA	2	6	949	954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	47525234
23	NC_002939	GGAA	2	8	971	978	50 %	0 %	50 %	0 %	47525234
24	NC_002939	TCA	2	6	982	987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	47525234
25	NC_002939	CAT	2	6	1058	1063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	47525234
26	NC_002939	GAT	2	6	1094	1099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	47525234
27	NC_002939	CGG	2	6	1250	1255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	47525234
28	NC_002939	CAT	2	6	1271	1276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	47525234
29	NC_002939	CTC	2	6	1302	1307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	47525234
30	NC_002939	CAA	2	6	1372	1377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_002939	CATAAC	2	12	1554	1565	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_002939	ATG	2	6	1567	1572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002939	AGG	2	6	1584	1589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002939	AGA	2	6	1637	1642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39995112
35	NC_002939	TCG	2	6	1652	1657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39995112
36	NC_002939	GATCG	2	10	1711	1720	20 %	20 %	40 %	20 %	39995112
37	NC_002939	AAG	2	6	1807	1812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39995112
38	NC_002939	CGA	2	6	1839	1844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39995112
39	NC_002939	TCC	2	6	1924	1929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	39995112
40	NC_002939	GAG	2	6	1930	1935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39995112
41	NC_002939	AG	3	6	1962	1967	50 %	0 %	50 %	0 %	39995112
42	NC_002939	TCA	2	6	1970	1975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39995112
43	NC_002939	CTG	2	6	1990	1995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39995112
44	NC_002939	GAG	3	9	2233	2241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39995112
45	NC_002939	CGT	2	6	2301	2306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39995112
46	NC_002939	TGG	2	6	2318	2323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39995112
47	NC_002939	GTG	2	6	2350	2355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39995112
48	NC_002939	TTC	2	6	2398	2403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39995112
49	NC_002939	GAA	2	6	2521	2526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39995112
50	NC_002939	AGC	2	6	2611	2616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39995112
51	NC_002939	TCAT	2	8	2787	2794	25 %	50 %	0 %	25 %	39995113
52	NC_002939	CGG	2	6	2859	2864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39995113
53	NC_002939	CCT	2	6	2924	2929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	39995113
54	NC_002939	C	6	6	2986	2991	0 %	0 %	0 %	100 %	39995113
55	NC_002939	T	6	6	3110	3115	0 %	100 %	0 %	0 %	39995113
56	NC_002939	CGC	2	6	3186	3191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39995113
57	NC_002939	CTC	2	6	3234	3239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	39995113
58	NC_002939	GCT	2	6	3257	3262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39995113
59	NC_002939	AGC	2	6	3265	3270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39995113
60	NC_002939	CTG	2	6	3279	3284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39995113
61	NC_002939	GGAT	2	8	3299	3306	25 %	25 %	50 %	0 %	39995113
62	NC_002939	AGG	2	6	3430	3435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39995113
63	NC_002939	CCG	2	6	3469	3474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39995113
64	NC_002939	G	6	6	3544	3549	0 %	0 %	100 %	0 %	39995113
65	NC_002939	CCA	2	6	3611	3616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39995113
66	NC_002939	AGC	2	6	3631	3636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39995113
67	NC_002939	GCC	2	6	3698	3703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39995113
68	NC_002939	CTG	2	6	3711	3716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39995113
69	NC_002939	GAC	2	6	3717	3722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39995113
70	NC_002939	TGA	2	6	3760	3765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39995113
71	NC_002939	ACC	3	9	3801	3809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39995113
72	NC_002939	CGT	2	6	3850	3855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39995113
73	NC_002939	CGA	2	6	3906	3911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39995114
74	NC_002939	CCA	2	6	4017	4022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39995114
75	NC_002939	CCAT	2	8	4094	4101	25 %	25 %	0 %	50 %	39995114
76	NC_002939	GGT	2	6	4119	4124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39995114
77	NC_002939	CGG	3	9	4175	4183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39995114
78	NC_002939	TCC	2	6	4199	4204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	39995114
79	NC_002939	CGG	2	6	4209	4214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39995114
80	NC_002939	ACA	2	6	4223	4228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39995114
81	NC_002939	CCT	2	6	4229	4234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	39995114
82	NC_002939	CGG	2	6	4245	4250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39995114
83	NC_002939	CGGGGT	2	12	4257	4268	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	39995114
84	NC_002939	AGCTGG	2	12	4295	4306	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	39995114
85	NC_002939	CGGGA	2	10	4315	4324	20 %	0 %	60 %	20 %	39995114
86	NC_002939	GCG	2	6	4349	4354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39995114
87	NC_002939	TCC	2	6	4415	4420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	39995114
88	NC_002939	CGA	2	6	4422	4427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39995114
89	NC_002939	ATCACC	2	12	4513	4524	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	39995114
90	NC_002939	GAG	2	6	4534	4539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39995114
91	NC_002939	CAC	2	6	4546	4551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39995114
92	NC_002939	AGG	2	6	4566	4571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39995114
93	NC_002939	CAA	2	6	4719	4724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39995114
94	NC_002939	TGG	2	6	4754	4759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39995114
95	NC_002939	GGC	2	6	4767	4772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39995114
96	NC_002939	GCC	3	9	4798	4806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39995114
97	NC_002939	CTC	2	6	4813	4818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	39995114
98	NC_002939	CGG	2	6	4868	4873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39995114
99	NC_002939	AGACCA	2	12	4913	4924	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	39995114
100	NC_002939	CAT	2	6	5019	5024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39995114
101	NC_002939	GGC	2	6	5040	5045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39995114
102	NC_002939	TGG	2	6	5174	5179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39995114
103	NC_002939	CCG	2	6	5189	5194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39995114
104	NC_002939	GAAAG	2	10	5247	5256	60 %	0 %	40 %	0 %	39995114
105	NC_002939	TCC	2	6	5296	5301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	39995114
106	NC_002939	GAC	2	6	5350	5355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39995114
107	NC_002939	ACC	2	6	5378	5383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39995114
108	NC_002939	ATC	2	6	5386	5391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39995114
109	NC_002939	CCGACG	2	12	5399	5410	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	39995114
110	NC_002939	GCT	3	9	5433	5441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39995114
111	NC_002939	CTT	3	9	5445	5453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39995114
112	NC_002939	GGT	2	6	5469	5474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39995114
113	NC_002939	C	7	7	5503	5509	0 %	0 %	0 %	100 %	39995114
114	NC_002939	GGC	2	6	5556	5561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39995114
115	NC_002939	CCT	2	6	5574	5579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	39995114
116	NC_002939	GAG	2	6	5581	5586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39995114
117	NC_002939	GCG	2	6	5618	5623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39995114
118	NC_002939	AGA	2	6	5624	5629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39995114
119	NC_002939	ATC	2	6	5647	5652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39995114
120	NC_002939	TGG	2	6	5669	5674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39995114
121	NC_002939	GAG	2	6	5719	5724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39995114
122	NC_002939	G	7	7	5757	5763	0 %	0 %	100 %	0 %	39995114
123	NC_002939	CGG	2	6	5820	5825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39995114
124	NC_002939	GAC	2	6	5842	5847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39995114
125	NC_002939	TGG	2	6	5936	5941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39995114
126	NC_002939	GGCCG	2	10	5977	5986	0 %	0 %	60 %	40 %	39995114
127	NC_002939	ACC	2	6	6019	6024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39995114
128	NC_002939	CCT	2	6	6036	6041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	39995114
129	NC_002939	CTT	2	6	6045	6050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39995114
130	NC_002939	AAG	2	6	6064	6069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39995114
131	NC_002939	TCCA	2	8	6076	6083	25 %	25 %	0 %	50 %	39995114
132	NC_002939	AGC	2	6	6116	6121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39995114
133	NC_002939	ACC	2	6	6130	6135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39995114
134	NC_002939	CCG	2	6	6234	6239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39995114
135	NC_002939	TCA	2	6	6498	6503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39995115
136	NC_002939	CCG	2	6	6550	6555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39995115
137	NC_002939	ACA	2	6	6591	6596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39995115
138	NC_002939	GGT	2	6	6619	6624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39995115
139	NC_002939	CGG	2	6	6663	6668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39995115
140	NC_002939	TGG	2	6	6720	6725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39995115
141	NC_002939	CGG	2	6	6765	6770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39995115
142	NC_002939	ACG	2	6	6861	6866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39995115
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144	NC_002939	CTC	2	6	6925	6930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	39995115
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146	NC_002939	TCA	2	6	6984	6989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39995115
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150	NC_002939	GGGA	2	8	7092	7099	25 %	0 %	75 %	0 %	39995115
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152	NC_002939	ACCGG	2	10	7113	7122	20 %	0 %	40 %	40 %	39995115
153	NC_002939	CGGGCC	2	12	7142	7153	0 %	0 %	50 %	50 %	39995115
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158	NC_002939	CGA	2	6	7294	7299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39995115
159	NC_002939	CGGGA	2	10	7307	7316	20 %	0 %	60 %	20 %	39995115
160	NC_002939	CCT	2	6	7398	7403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	39995115
161	NC_002939	GGCGG	2	10	7429	7438	0 %	0 %	80 %	20 %	39995115
162	NC_002939	ACC	2	6	7482	7487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39995115
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164	NC_002939	AAGG	2	8	7634	7641	50 %	0 %	50 %	0 %	39995115
165	NC_002939	CGA	2	6	7663	7668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39995115
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173	NC_002939	G	7	7	8073	8079	0 %	0 %	100 %	0 %	39995115
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179	NC_002939	CGA	3	9	8308	8316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39995115
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199	NC_002939	CGTGGC	2	12	8896	8907	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	39995115
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203	NC_002939	ATT	2	6	9017	9022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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241	NC_002939	CTGAT	2	10	10411	10420	20 %	40 %	20 %	20 %	400756306
242	NC_002939	TGG	2	6	10447	10452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400756306
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248	NC_002939	CAT	2	6	10649	10654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
249	NC_002939	ACG	2	6	10715	10720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39995117
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254	NC_002939	GTG	2	6	10970	10975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39995117
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262	NC_002939	GGC	2	6	11266	11271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39995117
263	NC_002939	GCTG	2	8	11482	11489	0 %	25 %	50 %	25 %	39995117
264	NC_002939	GA	3	6	11499	11504	50 %	0 %	50 %	0 %	39995117
265	NC_002939	TGG	2	6	11511	11516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39995117
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267	NC_002939	CCG	2	6	11557	11562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39995117
268	NC_002939	TTC	2	6	11830	11835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39995118
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272	NC_002939	CT	3	6	11975	11980	0 %	50 %	0 %	50 %	39995118
273	NC_002939	GCC	2	6	11999	12004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39995118
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397	NC_002939	TCTCC	2	10	18661	18670	0 %	40 %	0 %	60 %	39995121
398	NC_002939	CCCGT	2	10	18708	18717	0 %	20 %	20 %	60 %	39995121
399	NC_002939	AGG	2	6	18738	18743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39995121
400	NC_002939	CTG	2	6	18755	18760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39995121
401	NC_002939	CGA	2	6	18799	18804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39995121
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430	NC_002939	CGC	2	6	19815	19820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39995122
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432	NC_002939	CGGC	2	8	19931	19938	0 %	0 %	50 %	50 %	39995122
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439	NC_002939	TCTG	2	8	20286	20293	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
440	NC_002939	CGG	2	6	20327	20332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39995123
441	NC_002939	GGC	3	9	20340	20348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39995123
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470	NC_002939	CAG	2	6	21645	21650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39995123
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472	NC_002939	TC	4	8	21707	21714	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
473	NC_002939	GAT	2	6	21848	21853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39995124
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475	NC_002939	GAT	2	6	21902	21907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39995124
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478	NC_002939	CAG	2	6	22016	22021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39995124
479	NC_002939	GAG	2	6	22055	22060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39995124
480	NC_002939	ATC	2	6	22178	22183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
481	NC_002939	TGA	2	6	22227	22232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
482	NC_002939	G	6	6	22263	22268	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
483	NC_002939	GCA	2	6	22326	22331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39995125
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489	NC_002939	GCTTCA	2	12	22667	22678	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	39995125
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494	NC_002939	AGGG	2	8	22853	22860	25 %	0 %	75 %	0 %	39995125
495	NC_002939	GCG	2	6	22868	22873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39995125
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498	NC_002939	CCG	2	6	23156	23161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39995125
499	NC_002939	ACG	2	6	23226	23231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
500	NC_002939	C	7	7	23257	23263	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding

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